RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 APMAPQ9HDC9 416 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMBNQ9NP70 447 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDF3Q9NR23 364 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 OGDHLQ9ULD0 1010 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSF4Q9ULV5 492 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A15Q9Y619 301 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP4O75096 1905 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGSF1Q8N6C5 1336 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 BDP1A6H8Y1 2624 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANHXE9PGG2 379 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC1A7O00341 560 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF12O43508 249 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 AHCYL1O43865 530 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAPSAO96009 420 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 P0DMU3 169 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM231AP0DMU4 169 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM231CP0DMU5 169 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL4P12829 197 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACP5P13686 325 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHN1P15882 459 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRB3P28472 473 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCGR2CP31995 323 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR183P32249 361 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGCLP35914 325 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINF1P36955 418 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK7P49862 253 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBA2P53672 197 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD81P60033 236 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBPJQ06330 500 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGCGQ13326 291 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 HERC3Q15034 1050 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC18A3Q16572 532 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2SQ16763 222 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC27Q2M243 656 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALDH1L2Q3SY69 923 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA35Q5VZE5 725 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RINT1Q6NUQ1 792 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 C16orf86Q6ZW13 317 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOB3CQ70IA8 216 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADM2Q7Z4H4 148 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf56Q8IXR9 622 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RDH10Q8IZV5 341 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR3DL3Q8N743 410 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9Q2Q8NGE9 314 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGB4Q8WW32 186 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT35Q92764 455 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD17B14Q9BPX1 270 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF9Q9HAQ2 790 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAYSD1Q9NPB0 183 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTMR10Q9NXD2 777 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 DACT1Q9NYF0 836 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNG4Q9UBN1 327 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK11Q9UBX7 282 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK39Q9UEW8 545 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTUS1Q9ULD2 1270 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE10AQ9Y233 779 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCE1Q9Y256 329 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
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RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPM1 405 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf71A6NCJ1 209 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLTPD2A6NH11 291 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF860A6NHJ4 632 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNURFLB1AK76 121 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf94C9JXX5 98 aa-1.4□□□□□ -2.63
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