RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000386307.1

SNORD12C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12C, Length 89 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12C-201ENST00000386307 SLCO4A1Q96BD0 722 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 NXNL1Q96CM4 212 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 NXPE2Q96DL1 559 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM122AQ96E09 287 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 TIGD1Q96MW7 591 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 KLHL5Q96PQ7 755 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 PAFAH2Q99487 392 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 OLFM1Q99784 485 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 HSD17B14Q9BPX1 270 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 ITPAQ9BY32 194 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 ZBP1Q9H171 429 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 CUEDC2Q9H467 287 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 Q9H8V8 135 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 C3orf14Q9HBI5 128 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 Q9UF83 564 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 PILRBQ9UKJ0 227 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 PILRAQ9UKJ1 303 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 HIVEP2P31629 2446 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 ARHGAP23Q9P227 1491 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 GAKO14976 1311 aa0.65□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 SALL1Q9NSC2 1324 aa0.65□□□□□ -2.3
SNORD12C-201ENST00000386307 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 A0A1W2PQ67 120 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PI4KAP2A4QPH2 592 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 EPOPA6NHQ4 379 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF487B1APH4 448 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ERVV-1B6SEH8 477 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 E2F3O00716 465 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 FBP2O00757 339 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 AP3D1O14617 1153 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ECE2O60344 883 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 DFNA5O60443 496 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF253O75346 499 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 VENTXO95231 258 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 SEMA4FO95754 770 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PENKP01210 267 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 P0C879 139 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PGAM2P15259 253 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 MPZP25189 248 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 CTNNA2P26232 953 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PPP2R1BP30154 601 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PCGF2P35227 344 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 MDH2P40926 338 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ALDH3B1P43353 468 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 IST1P53990 364 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ADARP55265 1226 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 CDH13P55290 713 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 TLE4Q04727 773 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 SULT2A1Q06520 285 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 GRB14Q14449 540 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 KRT32Q14532 448 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PTPRCAPQ14761 206 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 NTRK2Q16620 822 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 SPANXN4Q5MJ08 99 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM211Q6ICI0 200 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 CGB2Q6NT52 195 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 Q6P435 159 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 C2orf66Q6UXQ4 117 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 Q6ZVQ6 151 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 AMIGO1Q86WK6 493 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 UBQLNLQ8IYU4 475 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 LYPD1Q8N2G4 141 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ARL14Q8N4G2 192 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF561Q8N587 486 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 MINDY1Q8N5J2 469 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 TBCKQ8TEA7 893 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 GRK7Q8WTQ7 553 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 GTSF1Q8WW33 167 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 FAF2Q96CS3 445 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 SIPA1Q96FS4 1042 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 PPM1MQ96MI6 270 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 NACAP1Q9BZK3 213 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 NMUR1Q9HB89 426 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 MYNNQ9NPC7 610 aa0.65□□□□□ -2.31
SNORD12C-201ENST00000386307 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms