RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384606.1

RNU6-658P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 658, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-658P, Length 106 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-658P-201ENST00000384606 LURAP1Q96LR2 239 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 LPAR4Q99677 370 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 POLE3Q9NRF9 147 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 PIGVQ9NUD9 493 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ACOXLQ9NUZ1 547 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 PANK4Q9NVE7 773 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 DONSONQ9NYP3 566 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TAAR2Q9P1P5 351 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TNNQ9UQP3 1299 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 RIPK3Q9Y572 518 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 E5RGE8 158 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLCO1B7G3V0H7 640 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCL24O00175 119 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 NDC80O14777 642 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHUKO15111 745 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC22A2O15244 555 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 NTN1O95631 604 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CAVIN2O95810 425 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLPTM1O96005 669 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GSTA2P09210 222 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CT45A8P0DMV1 189 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CT45A9P0DMV2 189 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SNHG28P0DPA3 235 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ETS1P14921 441 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 FCARP24071 287 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 MARK3P27448 753 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ALDH3B1P43353 468 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 MAGEA11P43364 429 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 RABIFP47224 123 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TNFSF10P50591 281 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SMSP52788 366 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GMFBP60983 142 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GALK2Q01415 458 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GABPAQ06546 454 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GPR50Q13585 617 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ITGA9Q13797 1035 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 P2RY6Q15077 328 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 STX1AQ16623 288 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CT45A2Q5DJT8 189 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF542PQ5EBM4 170 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 XKR3Q5GH77 459 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 DHRS11Q6UWP2 260 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC185Q8N715 623 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCNYQ8ND76 341 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 NEK11Q8NG66 645 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 SEPT8Q92599 483 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM143Q96AN5 459 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GIMAP5Q96F15 307 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 PSD2Q9BQI7 771 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 FTHL17Q9BXU8 183 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 THAP2Q9H0W7 228 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 MARCH7Q9H992 704 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-658P-201ENST00000384606 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms