RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-201ENST00000378543 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-201ENST00000378543 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-201ENST00000378543 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-201ENST00000378543 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-201ENST00000378543 OR2W5A6NFC9 320 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 GNAZP19086 355 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 GSTM2P28161 218 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A12P48065 614 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 IFT20Q8IY31 132 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 CNPY4Q8N129 248 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 PRR7Q8TB68 274 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ACOT9Q9Y305 439 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 A0A087X1B8 175 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 NDUFS4O43181 175 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ITGAMP11215 1152 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 HERC3Q15034 1050 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TLR1Q15399 786 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 PDPRQ8NCN5 879 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TRPV3Q8NET8 790 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 EHD1Q9H4M9 534 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 URADA6NGE7 173 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 FAM155BO75949 473 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 WFS1O76024 890 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 B3GALT4O96024 378 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SERPIND1P05546 499 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RNF224P0DH78 156 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 GP1BBP13224 206 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 IL10P22301 178 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ECHS1P30084 290 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SCTRP47872 440 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 REEP5Q00765 189 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 CDC16Q13042 620 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
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FAAP20-201ENST00000378543 TTLQ8NG68 377 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 PEX11GQ96HA9 241 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.18■■□□□ 1.14
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FAAP20-201ENST00000378543 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RNF112Q9ULX5 631 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJB6O75190 326 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 WDR47O94967 919 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINB9P50453 376 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ARG2P78540 354 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RGS1Q08116 209 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 NT5CQ8TCD5 201 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 GRHL3Q8TE85 626 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 WWOXQ9NZC7 414 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 SYCE1LA8MT33 242 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 KERAO60938 352 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 STK16O75716 305 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 UQCRHP07919 91 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 INHBAP08476 426 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ICAM2P13598 275 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ALOX12P18054 663 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 CNTFP26441 200 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.144e-6■■■□□ 17.4
FAAP20-201ENST00000378543 OR4D1Q15615 310 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB134Q4QY38 66 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 MROH9Q5TGP6 573 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD37Q7Z713 158 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 ISCA2Q86U28 154 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-201ENST00000378543 KRT78Q8N1N4 520 aa22.16■■□□□ 1.14
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