RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 WBP2Q969T9 261 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXPE2Q96DL1 559 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL12RB2Q99665 862 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf62Q9BQA9 187 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DESI2Q9BSY9 194 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUT8Q9BYC5 575 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf14Q9HBI5 128 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR173Q9NS66 373 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 POMT2Q9UKY4 750 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLCL2Q9UPR0 1127 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SATB2Q9UPW6 733 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITM2BQ9Y287 266 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFASO15067 1338 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF123Q5XPI4 1314 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANTXRLA6NF34 631 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKX6-3A6NJ46 265 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCER2I3L3R5 266 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF263O14978 683 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB2O15479 319 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTI1O43156 1089 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSL4O60488 711 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP9AO75110 1047 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAP2O75791 330 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLCEO94923 617 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ND2P03891 347 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT3P12035 628 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4BPBP20851 252 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTNNA2P26232 953 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRD5A2P31213 254 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC1A3P43003 542 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C14orf177Q52M58 125 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLRA4Q5JXX5 417 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC38Q5VT99 294 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf24Q7Z6I8 188 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TDHQ8IZJ6 230 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP37Q8NFH4 326 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFT1Q96AA3 541 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP2M1Q96CW1 435 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 POM121L2Q96KW2 1035 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LURAP1Q96LR2 239 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00479Q96M42 142 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASL10BQ96S79 203 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IDI2Q9BXS1 227 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 WWTR1Q9GZV5 400 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUEDC2Q9H467 287 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDE1Q9NXR1 346 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNIH4Q9P003 139 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 WIPI2Q9Y4P8 454 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACEP12821 1306 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM149AA5PLN7 773 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 KPNA7A9QM74 516 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRCH4O75427 683 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLN5O75503 358 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SBK2P0C263 348 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF883P0CG24 379 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 UROSP10746 265 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPEP1P16444 411 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT1A4P22310 534 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIFP27352 417 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDHA2P29803 388 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR183P32249 361 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms