RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CRHR2Q13324 411 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GPR176Q14439 515 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PEA15Q15121 130 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A19Q695T7 634 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CES3Q6UWW8 571 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ADCK2Q7Z695 626 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SNX33Q8WV41 574 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 S100PBPQ96BU1 408 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WWV3 80 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CYB5BO43169 146 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 C22orf31O95567 290 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL14O95715 111 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CHRNB2P17787 502 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SCNN1BP51168 640 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GPX6P59796 221 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 VAMP2P63027 116 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRKCZQ05513 592 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 NADK2Q4G0N4 442 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 XKR6Q5GH73 641 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 REEP3Q6NUK4 255 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 PLD5Q8N7P1 536 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 NLKQ9UBE8 527 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 MAFIPQ8WZ33 124 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 HSPB11Q9Y547 144 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 RECQL4O94761 1208 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCNK5O95279 499 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CAPSQ13938 189 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GPR150Q8NGU9 434 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GPR151Q8TDV0 419 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MUL1Q969V5 352 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR5B12Q96R08 314 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CD180Q99467 661 aa4.76□□□□□ -1.65
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