RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AMBNQ9NP70 447 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SDHDO14521 159 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AHSA1O95433 338 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCRC2P22695 453 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK14Q16539 360 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FATE1Q969F0 183 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MGME1Q9BQP7 344 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SRCP12931 536 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 BPIP17213 487 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TBPL1P62380 186 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MXD1Q05195 221 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF130Q86XS8 419 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT14Q8WUY8 206 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CD180Q99467 661 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SCML1Q9UN30 329 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM5Q9Y2B1 443 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM189A1O60320 539 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 VLDLRP98155 873 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PLGLB1Q02325 96 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MVKQ03426 396 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RTL10Q7L3V2 364 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GDE1Q9NZC3 331 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 JMJD7P0C870 316 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GP1BBP13224 206 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NTHL1P78549 312 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC50Q53HI1 259 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE7BQ9NP56 450 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PDLIM1O00151 329 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 JUNDP17535 347 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MTTPP55157 894 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIK2Q13002 908 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB6CQ53S08 254 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SYVN1Q86TM6 617 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 STRADBQ9C0K7 418 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRB3P13945 408 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NR4A1P22736 598 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FMO3P31513 532 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP97Q8IW35 865 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXJ1Q92949 421 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMTOR5O43504 91 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRB3O75022 631 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX4O95219 450 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RBBP4Q09028 425 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FADDQ13158 208 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TIGD6Q17RP2 521 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CRELD1Q96HD1 420 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF778Q96MU6 729 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A096LPI6 279 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DUX1O43812 170 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF217O75362 1048 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG9BQ674R7 924 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GLOD5A6NK44 160 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN25C9JDP6 229 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 EPCAMP16422 314 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms