RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC126Q96EE4 140 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 LRFN5Q96NI6 719 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 F2RL3Q96RI0 385 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF382Q96SR6 550 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DRC3Q9H069 523 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RHBGQ9H310 441 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NT5DC2Q9H857 520 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CTSFQ9UBX1 484 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TIMM22Q9Y584 194 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 H0YIV9 168 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SGK494L7N484 410 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TM9SF1O15321 606 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OTCP00480 354 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CXCR2P25025 360 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB3P29508 390 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DLSTP36957 453 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HTR6P50406 440 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PLA2G16P53816 162 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ARSFP54793 590 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OLR1P78380 273 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TLE3Q04726 772 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 LCP2Q13094 533 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 LAPTM5Q13571 262 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PWP1Q13610 501 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SGO1Q5FBB7 561 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MLIPQ5VWP3 458 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 AMER3Q8N944 861 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TRPV3Q8NET8 790 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NT5CQ8TCD5 201 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 AGAP11Q8TF27 550 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MS4A8Q9BY19 250 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OR51B5Q9H339 312 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SCN2AQ99250 2005 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OR2W5A6NFC9 320 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ITM2AO43736 263 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 UGDHO60701 494 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RDH16O75452 317 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 JRKO75564 520 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC3AO75596 197 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINA6P08185 405 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HBQ1P09105 142 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 EFNA3P52797 238 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RGS1Q08116 209 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 FAM53BQ14153 422 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MAP7Q14244 749 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP157Q5JU67 520 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM10Q96HG1 83 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MID2Q9UJV3 735 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WV48 116 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM233B4DJY2 109 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TXNDC9O14530 226 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms