RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 DPH7Q9BTV6 452 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 FBRSQ9HAH7 460 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 STRCQ7RTU9 1775 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 OR6C74A6NCV1 312 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 GRIK2Q13002 908 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 RTL10Q7L3V2 364 aa20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 LINC00471Q8N535 108 aa20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 CD200R1Q8TD46 325 aa20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.48■□□□□ 0.87
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LRP5-201ENST00000294304 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 17.5
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LRP5-201ENST00000294304 FAM170BA6NMN3 283 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 LILRB3O75022 631 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 ZNF823P16415 610 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 PTERQ96BW5 349 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP5-201ENST00000294304 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.46■□□□□ 0.87
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