RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	IL2RB	P14784	551 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	AOX1	Q06278	1338 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	REC8	O95072	547 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	SEC24B	O95487	1268 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	C5	P01031	1676 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	APBB1	O00213	710 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	CYP27B1	O15528	508 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	KCNQ3	O43525	872 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	MX1	P20591	662 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	MTX1	Q13505	466 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	ADCY9	O60503	1353 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	GRM8	O00222	908 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	MCC	P23508	829 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PDE1A	P54750	535 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	POLA2	Q14181	598 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	STRN4	Q9NRL3	753 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-231	ENST00000640501	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	UTY	O14607	1347 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ERC2	O15083	957 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SLC39A6	Q13433	755 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SNX21	Q969T3	373 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	LRP6	O75581	1613 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	MYL6B	P14649	208 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SDS	P20132	328 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	NBR1	Q14596	966 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	RABEP1	Q15276	862 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	COL15A1	P39059	1388 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PDIA6	Q15084	440 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	HIP1	O00291	1037 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ST18	O60284	1047 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TOM1	O60784	492 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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