RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 ST5P78524 1137 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF213O14771 459 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 FLIIQ13045 1269 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC181Q5TID7 509 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 LDHCP07864 332 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 BACH2Q9BYV9 841 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NEBLO76041 1014 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NEFHP12036 1026 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 SMTNL1A8MU46 457 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF4Q96M43 638 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 FEZ1Q99689 392 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 BAG3O95817 575 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 POTEJP0CG39 1038 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 RAB34Q9BZG1 259 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3R4Q99570 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 CABP5Q9NP86 173 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf76Q96K31 380 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 HLA-DOAP06340 250 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 MYO1BO43795 1136 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 EVI5LQ96CN4 794 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CTDP1-208ENST00000613122 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 TSG101Q99816 390 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP5P59047 1200 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 GOLIM4O00461 696 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 FERMT3Q86UX7 667 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf37Q96NL8 207 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1AP38606 617 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 PDE4BQ07343 736 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 GSTO1P78417 241 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 SETDB2Q96T68 719 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 MBIPQ9NS73 344 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K11Q16584 847 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 SNRKQ9NRH2 765 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 FAM83GA6ND36 823 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 KIF5BP33176 963 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 ASXL2Q76L83 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K1Q13233 1512 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 TSPY2A6NKD2 308 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 DDB1Q16531 1140 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1328Q86T90 577 aa23.46■■□□□ 1.35
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