RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PCNTO95613 3336 aa26.05■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.05■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 MTHFSP49914 203 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 RASSF7Q02833 373 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 TM4SF1P30408 202 aa26.02■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL6Q8N841 843 aa26.02■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 CREBZFQ9NS37 354 aa26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 TJP1Q07157 1748 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-208ENST00000608287 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.97■■□□□ 1.75
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SGMS1-208ENST00000608287 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.96■■□□□ 1.75
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SGMS1-208ENST00000608287 H0YIN7 160 aa25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 CHADLQ6NUI6 762 aa25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 AIDAQ96BJ3 306 aa25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 NARFQ9UHQ1 456 aa25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 NFIXQ14938 502 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 SERPINB2P05120 415 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 COL15A1P39059 1388 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 ERFEQ4G0M1 354 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 NFKBIEO00221 500 aa25.89■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 SLC34A2O95436 690 aa25.89■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SGMS1-208ENST00000608287 POTECB2RU33 542 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 CNTNAP1P78357 1384 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.87■■□□□ 1.73
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SGMS1-208ENST00000608287 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 FOXN1O15353 648 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 SOGA3Q5TF21 947 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 A0A087WZG4 1122 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 IL13P35225 146 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.728e-8■■■■□ 21.4
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SGMS1-208ENST00000608287 SCN4AP35499 1836 aa25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 MRC1P22897 1456 aa25.79■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 C21orf2O43822 256 aa25.78■■□□□ 1.72
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SGMS1-208ENST00000608287 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 STARD3NLO95772 234 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 PASKQ96RG2 1323 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-208ENST00000608287 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.75■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.74■■□□□ 1.71
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SGMS1-208ENST00000608287 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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SGMS1-208ENST00000608287 WBP1LQ9NX94 342 aa25.73■■□□□ 1.71
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SGMS1-208ENST00000608287 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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SGMS1-208ENST00000608287 POTEIP0CG38 1075 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 POTEJP0CG39 1038 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 PPP2R1AP30153 589 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 LBX1P52954 281 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 ST5P78524 1137 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 SLC39A6Q13433 755 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 CFAP53Q96M91 514 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-208ENST00000608287 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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