RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	TEF	Q10587	303 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-222	ENST00000597718	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-222	ENST00000597718	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FCHO1-222	ENST00000597718	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	FCHSD2	O94868	740 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	KCNA3	P22001	575 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TM4SF1	P30408	202 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	NUDC	Q9Y266	331 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		18.86	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	NARF	Q9UHQ1	456 aa		18.86	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	STARD3NL	O95772	234 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CHRNA5	P30532	468 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	NFIX	Q14938	502 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		18.85	■□□□□ 0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	KCNQ3	O43525	872 aa		18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	PIM2	Q9P1W9	311 aa		18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	BTBD11	A6QL63	1104 aa		18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.82	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	MCM10	Q7L590	875 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SCN7A	Q01118	1682 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SERPINB2	P05120	415 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	A1BG	P04217	495 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	DCTN1	Q14203	1278 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718		A0A087WZG4	1122 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	CEP350	Q5VT06	3117 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	KIF3C	O14782	793 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	USP16	Q9Y5T5	823 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	RASSF7	Q02833	373 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-222	ENST00000597718		H0YIN7	160 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NEFM	P07197	916 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	TTLL6	Q8N841	843 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	HSPA6	P17066	643 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NPHP1	O15259	732 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	SBF1	O95248	1867 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NBPF26	B4DH59	902 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NBPF15	Q8N660	670 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	CNBD1	Q8NA66	436 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	PDE6B	P35913	854 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	PRELP	P51888	382 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NFE2L2	Q16236	605 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-222	ENST00000597718	NFKBIE	O00221	500 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-222	ENST00000597718	TOMM70	O94826	608 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-222	ENST00000597718	ST5	P78524	1137 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-222	ENST00000597718	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-222	ENST00000597718	C21orf2	O43822	256 aa		18.63	■□□□□ 0.57

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