RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 TNP2Q05952 138 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 USP4Q13107 963 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ARTNQ5T4W7 220 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 LCE3BQ5TA77 95 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 SOCS7O14512 581 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 APBA3O96018 575 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G4AP47712 749 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 TLR1Q15399 786 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 DYRK3O43781 588 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ATP4AP20648 1035 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ALAS2P22557 587 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 SIRT1Q96EB6 747 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PNR3 127 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 APBB1O00213 710 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 CD33P20138 364 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 LAMC2Q13753 1193 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF11Q86T75 865 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 BANK1Q8NDB2 785 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 AIDAQ96BJ3 306 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 NACC1Q96RE7 527 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 FAM157BP0CG42 384 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ELOA3Q8NG57 546 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 HCN2Q9UL51 889 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD11A6QL63 1104 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 GPR37L1O60883 481 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 INHAP05111 366 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 MARK1Q9P0L2 795 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SMTNP53814 917 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 CDK2AP1O14519 115 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SIN3BO75182 1162 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SCNN1DP51172 638 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 GDF10P55107 478 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ZIC5Q96T25 663 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 MDFIQ99750 246 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 EFSO43281 561 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 LRP8Q14114 963 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SYT9Q86SS6 491 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf172C9J069 976 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 M0R082 166 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 STRN4Q9NRL3 753 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-204ENST00000577468 MTFR1Q15390 333 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 A6NJY4 79 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 FAM229AH3BQW9 127 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 HOMEZQ8IX15 550 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms