RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 CHAMP1Q96JM3 812 aa12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TIGD1Q96MW7 591 aa12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TNNT1P13805 278 aa12.89□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 APBB1O00213 710 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CHL1O00533 1208 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 HMOX1P09601 288 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PDCP20941 246 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SYT1P21579 422 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 DRC7Q8IY82 874 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 KIF18AQ8NI77 898 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 MEIS3Q99687 375 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PALD1Q9ULE6 856 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 RAD50Q92878 1312 aa12.88□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 DLC1Q96QB1 1528 aa12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TUBB4AP04350 444 aa12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 KRT85P78386 507 aa12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PDE4CQ08493 712 aa12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 FIBPO43427 364 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 RAB11FIP3O75154 756 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SLFN14P0C7P3 912 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TERF2Q15554 542 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SPC24Q8NBT2 197 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 RILPL2Q969X0 211 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ITSN1Q15811 1721 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PTGS1P23219 599 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ERO1AQ96HE7 468 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TTC14Q96N46 770 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PRAM1Q96QH2 718 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CDK19Q9BWU1 502 aa12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ZNF75DP51815 510 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TYRO3Q06418 890 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CEP135Q66GS9 1140 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 MPNDQ8N594 471 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 RUFY2Q8WXA3 655 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TM6SF1Q9BZW5 370 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TMEM51Q9NW97 253 aa12.85□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 FAM177BA6PVY3 158 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ATP8B2P98198 1209 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 VPS53Q5VIR6 699 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CCDC186Q7Z3E2 898 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 KCND1Q9NSA2 647 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CABP1Q9NZU7 370 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TCHHQ07283 1943 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TNRQ92752 1358 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.84□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 CNTROBQ8N137 903 aa12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TRIM5Q9C035 493 aa12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 TNMDQ9H2S6 317 aa12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 FAM53CQ9NYF3 392 aa12.83□□□□□ -0.35
LMO3-215ENST00000537304 ALKQ9UM73 1620 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 SGSM2O43147 1006 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 AK2P54819 239 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 SARM1Q6SZW1 724 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 STK26Q9P289 416 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 MTMR6Q9Y217 621 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 MRVI1Q9Y6F6 885 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.83□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 SLC4A2P04920 1241 aa12.82□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 PTPN14Q15678 1187 aa12.82□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 COG3Q96JB2 828 aa12.82□□□□□ -0.36
LMO3-215ENST00000537304 STK31Q9BXU1 1019 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms