RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 FSTL1Q12841 308 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 RRAGCQ9HB90 399 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-210ENST00000527027 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 COL15A1P39059 1388 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 SERPINB2P05120 415 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRU-210ENST00000527027 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 STARD3NLO95772 234 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRU-210ENST00000527027 RASSF7Q02833 373 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRU-210ENST00000527027 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 HTRA3P83110 453 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-210ENST00000527027 A0A087WZG4 1122 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 H0YIN7 160 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRU-210ENST00000527027 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 GLTPD2A6NH11 291 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 TEFQ10587 303 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF790Q6PG37 636 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 JMYQ8N9B5 988 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 IL17REQ8NFR9 667 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 SBF1O95248 1867 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRU-210ENST00000527027 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 WDR90Q96KV7 1748 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-210ENST00000527027 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 NFKBIEO00221 500 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 PDE6BP35913 854 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRU-210ENST00000527027 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 PCNTO95613 3336 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 C21orf2O43822 256 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 A1BGP04217 495 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 SETDB2Q96T68 719 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-210ENST00000527027 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
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PTPRU-210ENST00000527027 CAMTA2O94983 1202 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRU-210ENST00000527027 CNKSR1Q969H4 720 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRU-210ENST00000527027 ST5P78524 1137 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 STYK1Q6J9G0 422 aa21.59■■□□□ 1.05
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PTPRU-210ENST00000527027 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 USP16Q9Y5T5 823 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-210ENST00000527027 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 MASTLQ96GX5 879 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 SOGA3Q5TF21 947 aa21.56■■□□□ 1.04
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