RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 USP44Q9H0E7 712 aa20.43■□□□□ 0.86
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CXCL3-204ENST00000511669 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.42■□□□□ 0.86
CXCL3-204ENST00000511669 SLC39A6Q13433 755 aa20.42■□□□□ 0.86
CXCL3-204ENST00000511669 ERBB4Q15303 1308 aa20.42■□□□□ 0.86
CXCL3-204ENST00000511669 ADCY9O60503 1353 aa20.42■□□□□ 0.86
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CXCL3-204ENST00000511669 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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CXCL3-204ENST00000511669 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-204ENST00000511669 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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CXCL3-204ENST00000511669 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.33■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 MYL6BP14649 208 aa20.33■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.33■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.33■□□□□ 0.84
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CXCL3-204ENST00000511669 COPS6Q7L5N1 327 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 USP35Q9P2H5 1018 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 MYT1Q01538 1121 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 USP16Q9Y5T5 823 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 LRP6O75581 1613 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 PDE1AP54750 535 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 MX1P20591 662 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 BCL11AQ9H165 835 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 DISP2A7MBM2 1401 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 TNS2Q63HR2 1409 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 EXOC5O00471 708 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 GLI3P10071 1580 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-204ENST00000511669 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.27■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 MYD88Q99836 296 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 STAP2Q9UGK3 403 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 REC8O95072 547 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 SDSP20132 328 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 GCKRQ14397 625 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-204ENST00000511669 GPATCH3Q96I76 525 aa20.24■□□□□ 0.83
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