RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 VPS72Q15906 364 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 HMMRO75330 724 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 GNAI3P08754 354 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 PHKG2P15735 406 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 GNAI2P04899 355 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 POTEAQ6S8J7 498 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 ATRNO75882 1429 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-208ENST00000502484 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.21□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.21□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.21□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 RXRBP28702 533 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 USP44Q9H0E7 712 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF790Q6PG37 636 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF5Q96JK2 942 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JS52 829 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 CYP27B1O15528 508 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY9O60503 1353 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 EP400Q96L91 3159 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ATP8B2P98198 1209 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 GLI3P10071 1580 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 BEND3Q5T5X7 828 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ANXA1P04083 346 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 C22orf23Q9BZE7 217 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A3P48751 1232 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A6Q13433 755 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 TTC22Q5TAA0 569 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 HYPKQ9NX55 129 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PAPPAQ13219 1627 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PROSER3Q2NL68 480 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 BARGINQ6ZT62 677 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 BECN1Q14457 450 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 KSR2Q6VAB6 950 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 IL2RBP14784 551 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 PDIA6Q15084 440 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SSH3Q8TE77 659 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 CDC45O75419 566 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH1L1O75891 902 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.15□□□□□ -0.78
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PDE4D-208ENST00000502484 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 CABP4P57796 275 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 POLA2Q14181 598 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.13□□□□□ -0.79
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