RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.14■■□□□ 1.94
USP13-202ENST00000482333 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
USP13-202ENST00000482333 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.14■■□□□ 1.94
USP13-202ENST00000482333 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 KSR2Q6VAB6 950 aa27.13■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.13■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 USP16Q9Y5T5 823 aa27.13■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 ATP8B2P98198 1209 aa27.12■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.11■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.1■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.1■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 DISP2A7MBM2 1401 aa27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 PAPPAQ13219 1627 aa27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 APBB1O00213 710 aa27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 MYL6BP14649 208 aa27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.08■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.08■■□□□ 1.93
USP13-202ENST00000482333 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.08■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 PIP4K2BP78356 416 aa27.07■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 ALDH1L1O75891 902 aa27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 BCL11AQ9H165 835 aa27.06■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 TOM1O60784 492 aa27.05■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 ADAMTS2O95450 1211 aa27.05■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.05■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.05■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.04■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 COPS6Q7L5N1 327 aa27.03■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 LINS1Q8NG48 757 aa27.02■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 SSH3Q8TE77 659 aa27.02■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 TNS2Q63HR2 1409 aa27.02■■□□□ 1.92
USP13-202ENST00000482333 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.01■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.01■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.01■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 POLA2Q14181 598 aa27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NRAPQ86VF7 1730 aa27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 ERICH6Q7L0X2 663 aa27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.99■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 IGKV5-2P06315 115 aa26.98■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.98■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 TTC22Q5TAA0 569 aa26.98■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NBPF26B4DH59 902 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NBPF14Q5TI25 921 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 NBPF15Q8N660 670 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 ITGB4P16144 1822 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.97■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 SRGAP3O43295 1099 aa26.96■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 PIGBQ92521 554 aa26.96■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 UTYO14607 1347 aa26.95■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 ERBB4Q15303 1308 aa26.95■■□□□ 1.91
USP13-202ENST00000482333 GRM8O00222 908 aa26.95■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.94■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.94■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 MYD88Q99836 296 aa26.94■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.94■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.94■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 EXOC5O00471 708 aa26.93■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 MTX1Q13505 466 aa26.93■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.93■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.93■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.93■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.92■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 A1BGP04217 495 aa26.92■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 KAZALD1Q96I82 304 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 LRP6O75581 1613 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 PDE1AP54750 535 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 GCKRQ14397 625 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 SUCLG2Q96I99 432 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.91■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 SLC4A3P48751 1232 aa26.9■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 ATG3Q9NT62 314 aa26.9■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 CDC45O75419 566 aa26.89■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.89■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.89■■□□□ 1.9
USP13-202ENST00000482333 RAB11FIP3O75154 756 aa26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms