RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SHPRHQ149N8 1683 aa6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FYB1O15117 783 aa6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRAM1Q96QH2 718 aa6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BACH2Q9BYV9 841 aa6.94□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMPD1P17405 629 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HIC1Q14526 733 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRBNQ96SW2 442 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDK19Q9BWU1 502 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNRQ92752 1358 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.93□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CPS1P31327 1500 aa6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.92□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.91□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPR37O15354 613 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 THAP11Q96EK4 314 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.9□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GNPATO15228 680 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLIN1O60240 522 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CABP1Q9NZU7 370 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP35Q9P2H5 1018 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PIK3R4Q99570 1358 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLIT1O75093 1534 aa6.89□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DIP2AQ14689 1571 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTCH1Q13635 1447 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 J3QL48 77 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEFMP07197 916 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GMPRP36959 345 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SENP2Q9HC62 589 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STK26Q9P289 416 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TBX22Q9Y458 520 aa6.88□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 METP08581 1390 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF16BQ96L93 1317 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WNT7AO00755 349 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POLKQ9UBT6 870 aa6.87□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCAR3O75815 825 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MORN1Q5T089 497 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HPS1Q92902 700 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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