RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PZPP20742 1482 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ECEL1O95672 775 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAX3P23760 479 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IL16Q14005 1332 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PSMD2Q13200 908 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOPCQ9HD26 462 aa8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYBL2P10244 700 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HSCBQ8IWL3 235 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RMI1Q9H9A7 625 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ST7Q9NRC1 585 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.67□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CPP00450 1065 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TPM4P67936 248 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF280DQ6N043 979 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NME8Q8N427 588 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IQUBQ8NA54 791 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VEZTQ9HBM0 779 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLIN1O60240 522 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMTNL1A8MU46 457 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMC5Q8IY18 1101 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TEX11Q8IYF3 940 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.65□□□□□ -1.02
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.65□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TONSLQ96HA7 1378 aa8.65□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP8P40818 1118 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GGT6Q6P531 493 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NLRP13Q86W25 1043 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAP3K1Q13233 1512 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SGSM2O43147 1006 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IVLP07476 585 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RPS6KA3P51812 740 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SUN2Q9UH99 717 aa8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NAT1P18440 290 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MNAT1P51948 309 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ICA1Q05084 483 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GRIK3Q13003 919 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MTA3Q9BTC8 594 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OATP04181 439 aa8.63□□□□□ -1.03
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 POTEAQ6S8J7 498 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms