RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.78■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 CACNA1FO60840 1977 aa22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 TSPY26PQ9H489 355 aa22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CITED2-201ENST00000367651 AOX1Q06278 1338 aa22.77■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K5Q99683 1374 aa22.76■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.76■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 DIP2AQ14689 1571 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 HOXC9P31274 260 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHG5O94827 1062 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 RASEFQ8IZ41 740 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 RAD50Q92878 1312 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 DTNBO60941 627 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 TERF1P54274 439 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 POLA2Q14181 598 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 SGSM2O43147 1006 aa22.73■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 NLRP6P59044 892 aa22.73■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.73■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.72■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 TTC14Q96N46 770 aa22.72■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.72■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 MPNDQ8N594 471 aa22.71■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 CPA1P15085 419 aa22.71■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 AK2P54819 239 aa22.71■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.71■■□□□ 1.23
CITED2-201ENST00000367651 SRGAP3O43295 1099 aa22.7■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 RUFY3Q7L099 469 aa22.7■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 MCM5P33992 734 aa22.7■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.225e-9■□□□□ 9.8
CITED2-201ENST00000367651 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 UQCRHP07919 91 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 RAB11FIP3O75154 756 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 LARGE1O95461 756 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 SPG7Q9UQ90 795 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.68■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.68■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 ANXA1P04083 346 aa22.67■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 SYT1P21579 422 aa22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.66■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 KCNQ3O43525 872 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 USP25Q9UHP3 1055 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 BEND3Q5T5X7 828 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 ZMYND15Q9H091 742 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 LGR6Q9HBX8 967 aa22.64■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.64■■□□□ 1.22
CITED2-201ENST00000367651 STX6O43752 255 aa22.64■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 PHF14O94880 888 aa22.64■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.64■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CNTROBQ8N137 903 aa22.64■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 PTH1RQ03431 593 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 FIBPO43427 364 aa22.62■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.62■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 F13A1P00488 732 aa22.62■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.61■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 ADCY9O60503 1353 aa22.61■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 ST3GAL1Q11201 340 aa22.61■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 HYPKQ9NX55 129 aa22.61■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.6■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.6■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.6■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 ABTB2Q8N961 1025 aa22.6■■□□□ 1.21
CITED2-201ENST00000367651 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms