RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-201ENST00000351328 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-201ENST00000351328 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.84□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 CABP4P57796 275 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 TEFQ10587 303 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 WDR63Q8IWG1 891 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.83□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 IL16Q14005 1332 aa8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 MRC1P22897 1456 aa8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 KCNQ2O43526 872 aa8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 PIGBQ92521 554 aa8.82□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.81□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 CFAP44Q96MT7 982 aa8.81□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.81□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SBF2Q86WG5 1849 aa8.81□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 BTBD11A6QL63 1104 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 CHL1O00533 1208 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 TRIM37O94972 964 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ZNF853P0CG23 659 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 GNAI1P63096 354 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 IFT57Q9NWB7 429 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ITGB4P16144 1822 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 KIF20AO95235 890 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SLC20A2Q08357 652 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 GOLGA2Q08379 1002 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 EP400Q96L91 3159 aa8.8□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 NHSQ6T4R5 1651 aa8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 ATG3Q9NT62 314 aa8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.79□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.79□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 SLC39A6Q13433 755 aa8.78□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-201ENST00000351328 ILDR2Q71H61 639 aa8.78□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.78□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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CS-201ENST00000351328 APPP05067 770 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 KCNQ3O43525 872 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 BTAF1O14981 1849 aa8.76□□□□□ -1.01
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CS-201ENST00000351328 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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CS-201ENST00000351328 PALLDQ8WX93 1383 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 ANAPC15P60006 121 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 YY1AP1Q9H869 796 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 CERS3Q8IU89 383 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 GPATCH11Q8N954 259 aa8.75□□□□□ -1.01
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CS-201ENST00000351328 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.75□□□□□ -1.01
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CS-201ENST00000351328 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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CS-201ENST00000351328 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.013e-10■■■□□ 17.8
CS-201ENST00000351328 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.74□□□□□ -1.01
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