RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 KSR2Q6VAB6 950 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 USP16Q9Y5T5 823 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 PHLPP1O60346 1717 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 MYL6BP14649 208 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 GLI3P10071 1580 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 ALDH1L1O75891 902 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 PIP4K2BP78356 416 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 COPS6Q7L5N1 327 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-201ENST00000331789 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 PAPPAQ13219 1627 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 SSH3Q8TE77 659 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS2O95450 1211 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 DISP2A7MBM2 1401 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC4A3P48751 1232 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 POLA2Q14181 598 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 TTC22Q5TAA0 569 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 LINS1Q8NG48 757 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 TOM1O60784 492 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 SRGAP3O43295 1099 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 IGKV5-2P06315 115 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NBPF26B4DH59 902 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NBPF14Q5TI25 921 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 NBPF15Q8N660 670 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 MYD88Q99836 296 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 ITGB4P16144 1822 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-201ENST00000331789 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 TNS2Q63HR2 1409 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 GRM8O00222 908 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 PIGBQ92521 554 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 UTYO14607 1347 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 CDC45O75419 566 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 A1BGP04217 495 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 NRAPQ86VF7 1730 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 EXOC5O00471 708 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 PDE1AP54750 535 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 SUCLG2Q96I99 432 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 ERBB4Q15303 1308 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 KAZALD1Q96I82 304 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 RAB11FIP3O75154 756 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 MTX1Q13505 466 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 GCKRQ14397 625 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 SDSP20132 328 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms