RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 NBPF4Q96M43 638 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 TNS3Q68CZ2 1445 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF853P0CG23 659 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A1P11836 297 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE3AQ14432 1141 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC136Q96JN2 1154 aa13□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 DCTN1Q14203 1278 aa12.98□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 MBIPQ9NS73 344 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 SLIT3O75094 1523 aa12.97□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 PEAK1Q9H792 1746 aa12.97□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 AAMPQ13685 434 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 PROX2Q3B8N5 592 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.95□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TOM1O60784 492 aa12.94□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA2Q15822 529 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17REQ8NFR9 667 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0232Q92628 1395 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF16BQ96L93 1317 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K9P80192 1104 aa12.91□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 FBXW7Q969H0 707 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 WBP1LQ9NX94 342 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 SPG7Q9UQ90 795 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K5Q99683 1374 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 COL9A1P20849 921 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 EVA1CP58658 441 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.9□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TSPYL6Q8N831 410 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 CRB1P82279 1406 aa12.89□□□□□ -0.35
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RABGGTB-201ENST00000319942 PANK1Q8TE04 598 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 COG6Q9Y2V7 657 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE2BO14633 110 aa12.87□□□□□ -0.35
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