RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 OGFRQ9NZT2 677 aa23.05■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 TCHHQ07283 1943 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 CHMLP26374 656 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 C14orf37Q86TY3 774 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 MEIS3Q99687 375 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 STAP2Q9UGK3 403 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 PALD1Q9ULE6 856 aa23.04■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.03■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 CDK19Q9BWU1 502 aa23.02■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 CHL1O00533 1208 aa23.01■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGEF10O15013 1369 aa23.01■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.01■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.01■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 CABP1Q9NZU7 370 aa23.01■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 C19orf44Q9H6X5 657 aa23■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 ANO2Q9NQ90 1003 aa23■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 HSPA4P34932 840 aa23■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 CERKQ8TCT0 537 aa22.99■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.98■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 APBB1O00213 710 aa22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 SMTNL1A8MU46 457 aa22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 STX6O43752 255 aa22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 F13A1P00488 732 aa22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 FGD1P98174 961 aa22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC192P0DO97 292 aa22.96■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 GNAI2P04899 355 aa22.96■■□□□ 1.27
MVB12A-201ENST00000317040 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.95■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 FAM193AP78312 1265 aa22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 TTC14Q96N46 770 aa22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.94■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 MPNDQ8N594 471 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 FAM83GA6ND36 823 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 KRT24Q2M2I5 525 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 ITSN1Q15811 1721 aa22.93■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 SYT1P21579 422 aa22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 RAD50Q92878 1312 aa22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 AP5Z1O43299 807 aa22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 ATF3P18847 181 aa22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 GNAI3P08754 354 aa22.91■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 FAM177BA6PVY3 158 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 ATP8B2P98198 1209 aa22.89■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 RILPL2Q969X0 211 aa22.89■■□□□ 1.26
MVB12A-201ENST00000317040 DCCP43146 1447 aa22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 NUTM2FA1L443 756 aa22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 ELP1O95163 1332 aa22.88■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 SLC4A2P04920 1241 aa22.88■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 DCTN1Q14203 1278 aa22.88■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 CRB1P82279 1406 aa22.87■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.87■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 FIBPO43427 364 aa22.86■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.86■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 FBLN1P23142 703 aa22.86■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MVB12A-201ENST00000317040 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms