RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PKN3-201ENST00000291906 USP54Q70EL1 1684 aa20.73■□□□□ 0.91
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PKN3-201ENST00000291906 USP16Q9Y5T5 823 aa20.72■□□□□ 0.91
PKN3-201ENST00000291906 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.72■□□□□ 0.91
PKN3-201ENST00000291906 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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PKN3-201ENST00000291906 ADCY9O60503 1353 aa20.72■□□□□ 0.91
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PKN3-201ENST00000291906 HYPKQ9NX55 129 aa20.7■□□□□ 0.9
PKN3-201ENST00000291906 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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PKN3-201ENST00000291906 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
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PKN3-201ENST00000291906 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.66■□□□□ 0.9
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PKN3-201ENST00000291906 NCAPD2Q15021 1401 aa20.66■□□□□ 0.9
PKN3-201ENST00000291906 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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PKN3-201ENST00000291906 GSE1Q14687 1217 aa20.64■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.64■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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PKN3-201ENST00000291906 ALS2Q96Q42 1657 aa20.62■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.62■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 RAB11FIP3O75154 756 aa20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 POLA2Q14181 598 aa20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 IGKV5-2P06315 115 aa20.6■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 SNX21Q969T3 373 aa20.6■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.6■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 CHMLP26374 656 aa20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 RABEP1Q15276 862 aa20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.59■□□□□ 0.89
PKN3-201ENST00000291906 IL2RBP14784 551 aa20.59■□□□□ 0.89
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PKN3-201ENST00000291906 NEK4P51957 841 aa20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 BTG4Q9NY30 223 aa20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.57■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.56■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 MCM4P33991 863 aa20.55■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.55■□□□□ 0.88
PKN3-201ENST00000291906 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.55■□□□□ 0.88
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