RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 TESK2Q96S53 571 aa9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 GPTP24298 496 aa9.61□□□□□ -0.87
NANOG-201ENST00000229307 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.61□□□□□ -0.87
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NANOG-201ENST00000229307 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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NANOG-201ENST00000229307 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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NANOG-201ENST00000229307 MBIPQ9NS73 344 aa9.58□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.58□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.58□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 MAP3K12Q12852 859 aa9.57□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.57□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 DRC7Q8IY82 874 aa9.56□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 EYA3Q99504 573 aa9.56□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 FAM83GA6ND36 823 aa9.55□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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NANOG-201ENST00000229307 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.55□□□□□ -0.88
NANOG-201ENST00000229307 KSR2Q6VAB6 950 aa9.55□□□□□ -0.88
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