RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.4□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.4□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CTIF-208ENST00000590422 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MAGEB16A2A368 324 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FAM227AF5H4B4 570 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNHIT1O43257 154 aa11.39□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 HRH2P25021 359 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 HTR1EP28566 365 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CD96P40200 585 aa11.39□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 OLR1P78380 273 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 OR1C1Q15619 314 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SPINK14Q6IE38 97 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PCGF5Q86SE9 256 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C17orf64Q86WR6 236 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CALML6Q8TD86 181 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PYCR2Q96C36 320 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 THAP11Q96EK4 314 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LINGO1Q96FE5 620 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SCMH1Q96GD3 660 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FRMD6Q96NE9 622 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR4K3Q96R72 315 aa11.39□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PARVBQ9HBI1 364 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MMP25Q9NPA2 562 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.39□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GABRR3A8MPY1 467 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NDUFS4O43181 175 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C8GP07360 202 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NPPBP16860 134 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PAFAH1B1P43034 410 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 EXT1Q16394 746 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LCTLQ6UWM7 567 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 RPTNQ6XPR3 784 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF354BQ96LW1 612 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GPR137Q96N19 417 aa11.38□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTIF-208ENST00000590422 C19orf84I3L1E1 186 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NEURL1O76050 574 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PGAM1P18669 254 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FNTAP49354 379 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC26A5P58743 744 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 HSF1Q00613 529 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 RBPJQ06330 500 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MEP1AQ16819 746 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 DEFB134Q4QY38 66 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MSS51Q4VC12 460 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SIAH3Q8IW03 269 aa11.37□□□□□ -0.59
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