RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CNPY3Q9BT09 278 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX25Q9H3E2 840 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CNIH4Q9P003 139 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 GGA2Q9UJY4 613 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH7Q9ULB5 785 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9Y3F1 56 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PATJQ8NI35 1801 aa4.06□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf60A6NFR6 353 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 OOEPA6NGQ2 149 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 KPNA7A9QM74 516 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PPEF2O14830 753 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MDM4O15151 490 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 INPPL1O15357 1258 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC3O43617 180 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 HUS1O60921 280 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC22BO75396 215 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CREG1O75629 220 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 JTBO76095 146 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ESRRBO95718 433 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 KLKB1P03952 638 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNE1P15382 129 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ADRA2CP18825 462 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MIPP30301 263 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PCGF2P35227 344 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP3P42574 277 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA4P43358 317 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SLCO1A2P46721 670 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS7P49802 495 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC8A3P57103 927 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 YPEL5P62699 121 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRPAP78324 504 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MZT1Q08AG7 82 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT33BQ14525 404 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 LPIN1Q14693 890 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRCAPQ14761 206 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED2Q15363 201 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB6Q15916 424 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TAZQ16635 292 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CDO1Q16878 200 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 VWC2Q2TAL6 325 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 BOLA3Q53S33 107 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG10Q5BKT4 473 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR73Q6P4I2 378 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM110Q86TL2 294 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT1Q86TX2 421 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 OCC1Q8TAD7 63 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 P3H4Q92791 437 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD8Q96I13 439 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 RITA1Q96K30 269 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf173Q96LM9 149 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 PEBP4Q96S96 227 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF670Q9BS34 389 aa4.05□□□□□ -1.76
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.05□□□□□ -1.76
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