RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 RHAGQ02094 409 aa20.39■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.39■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 H3BMM5 538 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 SPA17Q15506 151 aa20.34■□□□□ 0.85
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