RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	STMN1	P16949	149 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ALOX12	P18054	663 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	IL1RN	P18510	177 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GNAZ	P19086	355 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SAT1	P21673	171 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GSTM2	P28161	218 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MAGEA4	P43358	317 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	XCR1	P46094	333 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC12A2	P55011	1212 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ATP6V0D1	P61421	351 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	REEP5	Q00765	189 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NAB1	Q13506	487 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TGFBI	Q15582	683 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TRADD	Q15628	312 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CUZD1	Q86UP6	607 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SMIM10	Q96HG1	83 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	URAD	A6NGE7	173 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SGK494	L7N484	410 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NDUFS4	O43181	175 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	STATH	P02808	62 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	STX2	P32856	288 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	AGTR2	P50052	363 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RAB10	P61026	200 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RGS1	Q08116	209 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	HYAL2	Q12891	473 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TLR1	Q15399	786 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	HAS2	Q92819	552 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KIAA1191	Q96A73	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	EGFL8	Q99944	293 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	EHD1	Q9H4M9	534 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NT5DC2	Q9H857	520 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SVIL	O95425	2214 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TAPBP	O15533	448 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	JRK	O75564	520 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CBX6	O95503	412 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TUBB4A	P04350	444 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GNLY	P22749	145 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RHAG	Q02094	409 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CDC16	Q13042	620 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	E2F2	Q14209	437 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ABHD13	Q7L211	337 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GPSM1	Q86YR5	675 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68

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