RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 NEIL2Q969S2 332 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MOCOSQ96EN8 888 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PEX11GQ96HA9 241 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OR4K3Q96R72 315 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ERP44Q9BS26 406 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GPAMQ9HCL2 828 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 WHRNQ9P202 907 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GTF3C1Q12789 2109 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 URADA6NGE7 173 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TP73O15350 636 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RAD51CO43502 376 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 WDR47O94967 919 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ITGAMP11215 1152 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 AGTR2P50052 363 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HNMTP50135 292 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PLTPP55058 493 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SKP1P63208 163 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 POU4F1Q01851 419 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF33BQ06732 778 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PWP1Q13610 501 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PCOLCEQ15113 449 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NSDHLQ15738 373 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DEFB134Q4QY38 66 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ABHD13Q7L211 337 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CCDC25Q86WR0 208 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CEP97Q8IW35 865 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SHISA5Q8N114 240 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD7Q92527 254 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PSMF1Q92530 271 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HAS2Q92819 552 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.51□□□□□ -1.05
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LMO3-222ENST00000540445 RHOJQ9H4E5 214 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OARD1Q9Y530 152 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PQ72 361 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 WIPF3A6NGB9 483 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FANCGO15287 622 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CHST10O43529 356 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 B4GALT2O60909 372 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 WDPCPO95876 746 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 B3GALT4O96024 378 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CCDC166P0CW27 439 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 STMN1P16949 149 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ALOX12P18054 663 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GNAZP19086 355 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 IL10P22301 178 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 AHRP35869 848 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GDF5P43026 501 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SCTRP47872 440 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RAB8AP61006 207 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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