RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GLRX5	Q86SX6	157 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC107	Q8WV48	283 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SUSD6	Q92537	303 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CASP10	Q92851	521 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FEV	Q99581	238 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	KRT23	Q9C075	422 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FN3K	Q9H479	309 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MYNN	Q9NPC7	610 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EVPL	Q92817	2033 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ERICH2	A1L162	156 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NEMP2	A6NFY4	417 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB5	O15062	677 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CLIC2	O15247	247 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	AP5Z1	O43299	807 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	STX6	O43752	255 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NMT2	O60551	498 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	WISP2	O76076	250 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CYP11B2	P19099	503 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CBL	P22681	906 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PSMA3	P25788	255 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN3	P26045	913 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	LHX1	P48742	406 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	FMO5	P49326	533 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PDX1	P52945	283 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TRDN	Q13061	729 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB17	Q13105	803 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CUL3	Q13618	768 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	E2F5	Q15329	346 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GRTP1	Q5TC63	336 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SHE	Q5VZ18	495 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NUP93	Q8N1F7	819 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC43	Q8N309	656 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RNF128	Q8TEB7	428 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IGSF21	Q96ID5	467 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MUS81	Q96NY9	551 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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