RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		E7EQ34	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AGPS	O00116	658 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BTN3A3	O00478	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PEX12	O00623	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LDB2	O43679	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	JRK	O75564	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UNC5C	O95185	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ONECUT2	O95948	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CD63	P08962	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PIRT	P0C851	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CBSL	P0DN79	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDH3	P22223	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HTR1E	P28566	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CBS	P35520	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HMGCL	P35914	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FOLR3	P41439	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GABRA4	P48169	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCT5	P48643	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FOXL2	P58012	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LINC00310	P59036	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UBE2H	P62256	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GBE1	Q04446	702 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDC16	Q13042	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	XRCC4	Q13426	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DOK3	Q7L591	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		Q8N3U1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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