RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 CT55Q8WUE5 264 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 DLG3Q92796 817 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TCTN2Q96GX1 697 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FUT8Q9BYC5 575 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 OPTCQ9UBM4 332 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FAM159BA6NKW6 160 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 E7ESA3 106 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 B4GALT2O60909 372 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FAM87AP0C7U9 286 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 LIFP15018 202 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CAPN3P20807 821 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FDXRP22570 491 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CRABP2P29373 138 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 AGTR2P50052 363 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 RAP1GDS1P52306 607 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CDH13P55290 713 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TMPRSS3P57727 454 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ABHD18Q0P651 414 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 GRM7Q14831 915 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MUM1Q2TAK8 710 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CFAP157Q5JU67 520 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FRMPD2BQ6IN97 320 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MGARPQ8TDB4 240 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FAR2Q96K12 515 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 HBEGFQ99075 208 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CUTCQ9NTM9 273 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SCN2AQ99250 2005 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CHD6Q8TD26 2715 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MYLKQ15746 1914 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 OR2W5A6NFC9 320 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 A8MUI8 341 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MASP2O00187 686 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 HAT1O14929 419 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CTSVO60911 334 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 STK16O75716 305 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SUPT7LO94864 414 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SERPINB9P50453 376 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TLE3Q04726 772 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CHIT1Q13231 466 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 HKDC1Q2TB90 917 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 DEFB134Q4QY38 66 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 EMBQ6PCB8 327 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 KRT78Q8N1N4 520 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 WNT2BQ93097 391 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CRB3Q9BUF7 120 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 XPR1Q9UBH6 696 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-205ENST00000519846 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms