RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ALPIP09923 528 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PKMP14618 531 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 AQP1P29972 269 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GDF5P43026 501 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MAPK12P53778 367 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 EFR3AQ14156 821 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0040Q15053 153 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PTCHD3Q3KNS1 767 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 C5orf22Q49AR2 442 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TSSK3Q96PN8 268 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TM4SF4P48230 202 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HSPA7P48741 367 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC11A2P49281 568 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TWF1Q12792 350 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GTF2H2Q13888 395 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 DTX3Q8N9I9 347 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ASB15Q8WXK1 588 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 K7ERQ8 282 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RPS19P39019 145 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GNPDA1P46926 289 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 BNC1Q01954 994 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 QPRTQ15274 297 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 IDO2Q6ZQW0 420 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HSH2DQ96JZ2 352 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SIGLEC11Q96RL6 698 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 EGFL8Q99944 293 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RFXANKO14593 260 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ULK1O75385 1050 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 C1QCP02747 245 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 POU2F1P14859 743 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 M6PRP20645 277 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 WEE1P30291 646 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SSTR4P31391 388 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HOXC5Q00444 222 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ESCO2Q56NI9 601 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PLET1Q6UQ28 207 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GLRX5Q86SX6 157 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 WFDC5Q8TCV5 224 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ULK4Q96C45 1275 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HDHD5Q9BXW7 423 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FAM83DQ9H4H8 585 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TMEM45AQ9NWC5 275 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 DUSP12Q9UNI6 340 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SCN5AQ14524 2016 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 A8MX80 341 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PLK4O00444 970 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GKP32189 559 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CDKN2CP42773 168 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SEMG2Q02383 582 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SCLYQ96I15 445 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HRASLS5Q96KN8 279 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FEVQ99581 238 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GDF15Q99988 308 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 BOCQ9BWV1 1114 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 APOL5Q9BWW9 433 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 VN1R3Q9BXE9 311 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RNF121Q9H920 327 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LRTM1Q9HBL6 345 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SMIM30A4D0T7 59 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MOXD2PA6NHM9 499 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SNTNA6NMZ2 147 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 AOC2O75106 756 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 OTCP00480 354 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms