RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	SP140	Q13342	867 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	INA	Q16352	499 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RELT	Q969Z4	430 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CERS2	Q96G23	380 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SNF8	Q96H20	258 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1B0GUH1	482 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	NDUFS4	O43181	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	CHST10	O43529	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC4	O95801	387 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SERPIND1	P05546	499 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	CD96	P40200	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	HNF4A	P41235	474 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	CCR8	P51685	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	IL2	P60568	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF460	Q14592	562 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	NSDHL	Q15738	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	CDC7	O00311	574 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	TP73	O15350	636 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	B4GALT2	O60909	372 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PIAS1	O75925	651 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	FH	P07954	510 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ALOX12	P18054	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	GRK3	P35626	688 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SCTR	P47872	440 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	OR4D2	P58180	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	RAB8A	P61006	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	BTG2	P78543	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	OR1C1	Q15619	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.19	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms