RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4-208ENST00000477413 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CSAG2Q9Y5P2 127 aa21.38■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.38■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SGK494L7N484 410 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 OR1F1O43749 312 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PIAS1O75925 651 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ICAM2P13598 275 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SAT1P21673 171 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 AGTR2P50052 363 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GUCY2DQ02846 1103 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 NAB1Q13506 487 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TGFBIQ15582 683 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.37■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 RDH16O75452 317 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 JRKO75564 520 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ALOX12P18054 663 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GSTM2P28161 218 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 STX2P32856 288 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SLC12A2P55011 1212 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PLTPP55058 493 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ATP6V0D1P61421 351 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 RGS1Q08116 209 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TLR1Q15399 786 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TRPV3Q8NET8 790 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 MOCOSQ96EN8 888 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CYTH2Q99418 400 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 LANCL2Q9NS86 450 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.36■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CD1DP15813 335 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 STMN1P16949 149 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GNAZP19086 355 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 RHAGQ02094 409 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 HYAL2Q12891 473 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ABHD13Q7L211 337 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PDPRQ8NCN5 879 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PLPP5Q8NEB5 264 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SMIM10Q96HG1 83 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 EGFL8Q99944 293 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 EHD1Q9H4M9 534 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.35■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 NAV2Q8IVL1 2488 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SERPINA6P08185 405 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 MAGEA4P43358 317 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 RAB10P61026 200 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TRADDQ15628 312 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 INAQ16352 499 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 GRTP1Q5TC63 336 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 SHISA5Q8N114 240 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 C19orf60Q96EN9 201 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 NTNG1Q9Y2I2 539 aa21.34■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 URADA6NGE7 173 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 MAGEB17A8MXT2 336 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CBX6O95503 412 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CCDC166P0CW27 439 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 CDC16Q13042 620 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 E2F2Q14209 437 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 H3F3CQ6NXT2 135 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 LANCL3Q6ZV70 420 aa21.33■■□□□ 1.01
CNIH4-208ENST00000477413 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms