RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ACOT9Q9Y305 439 aa22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 RDH16O75452 317 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 STK16O75716 305 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 HPP00738 406 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 GGT5P36269 586 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 XCR1P46094 333 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 KCNC1P48547 511 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 HSPA7P48741 367 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.69■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 TRPV3Q8NET8 790 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ESAMQ96AP7 390 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 MFRPQ9BY79 579 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.69■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 A0A087X1B8 175 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 HMX2A2RU54 273 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.68■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 ALOX12P18054 663 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 CSRP3P50461 194 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SNX31Q8N9S9 440 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 PDPRQ8NCN5 879 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NXNL1Q96CM4 212 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 FUT8Q9BYC5 575 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SNX15Q9NRS6 342 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 PCDH17O14917 1159 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 CLGNO14967 610 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT3HO75486 399 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 C2P06681 752 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 HNF4AP41235 474 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 MLLT10P55197 1068 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SKP1P63208 163 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 KCNC4Q03721 635 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB134Q4QY38 66 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD13Q7L211 337 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SHISA5Q8N114 240 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.67■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.67■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 INHBAP08476 426 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 COX6A1P12074 109 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 TYK2P29597 1187 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB8P50452 374 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 IRF9Q00978 393 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 Q0VFX4 171 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 IGFBP7Q16270 282 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 PDK4Q16654 411 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.66■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 IFT20Q8IY31 132 aa22.66■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.66■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NFU1Q9UMS0 254 aa22.66■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 A0A096LPK6 155 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 UBXN8O00124 270 aa22.65■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 EFNA3P52797 238 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 RAB8AP61006 207 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM205Q6UW68 189 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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