RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMEM205Q6UW68 189 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPM1NQ8N819 430 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANKRD53Q8N9V6 530 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TSLPQ969D9 159 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 VPS50Q96JG6 964 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF700Q9H0M5 742 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RHBGQ9H310 441 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EPS8L2Q9H6S3 715 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TXNDC16Q9P2K2 825 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OARD1Q9Y530 152 aa13.42□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM159BA6NKW6 160 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A8MUI8 341 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C4orf51C9J302 202 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TAPBPO15533 448 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHST10O43529 356 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KLHL41O60662 606 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 WDR47O94967 919 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAGEA4P43358 317 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARG2P78540 354 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 REEP5Q00765 189 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 POU4F1Q01851 419 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDC16Q13042 620 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CBLBQ13191 982 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MFAP5Q13361 173 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OR4D1Q15615 310 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FHL5Q5TD97 284 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANKRD37Q7Z713 158 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CMC1Q7Z7K0 106 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FBF1Q8TES7 1133 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDKL2Q92772 493 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EXT2Q93063 718 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RHBDF1Q96CC6 855 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RBBP8Q99708 897 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AICDAQ9GZX7 198 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC22A7Q9Y694 548 aa13.41□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FLNCQ14315 2725 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A0A0G2JN53 185 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM227AF5H4B4 570 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NDC80O14777 642 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 B4GALT2O60909 372 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CBX6O95503 412 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CD1DP15813 335 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ALOX12P18054 663 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SOX11P35716 441 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GP5P40197 560 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KCNC1P48547 511 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HYAL2Q12891 473 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADNP2Q6IQ32 1131 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NT5CQ8TCD5 201 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF592Q92610 1267 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GPR22Q99680 433 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CPNE1Q99829 537 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PELI2Q9HAT8 420 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LANCL2Q9NS86 450 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RIC8BQ9NVN3 520 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZFP69BQ9UJL9 534 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KCNE2Q9Y6J6 123 aa13.4□□□□□ -0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC88CQ9P219 2028 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAN1A2O60476 641 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRAMEF4O60810 478 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 WDPCPO95876 746 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 STMN1P16949 149 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC6A12P48065 614 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HSPA7P48741 367 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BTG2P78543 158 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RHAGQ02094 409 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RGS1Q08116 209 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DLG1Q12959 904 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PWP1Q13610 501 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLMAPQ14BN4 828 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABRAXAS2Q15018 415 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HERC3Q15034 1050 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TLR1Q15399 786 aa13.39□□□□□ -0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TGFBIQ15582 683 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms