RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CPXM2Q8N436 756 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1958Q8N8K9 716 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ATG16L2Q8NAA4 619 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SCAMP4Q969E2 229 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF566Q969W8 418 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ECHDC3Q96DC8 303 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TPD52L3Q96J77 140 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DEPDC7Q96QD5 511 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SNX18Q96RF0 628 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MAU2Q9Y6X3 613 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 METTL15A6NJ78 407 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PDZK1P1A8MUH7 402 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GFYI3L273 518 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AP3D1O14617 1153 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-FP30511 346 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PFN3P60673 137 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35A2P78381 396 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VLDLRP98155 873 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP69Q49AA0 526 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CHST14Q8NCH0 376 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MED8Q96G25 268 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRELID1Q9Y255 219 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PRU2 124 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OR2AG2A6NM03 316 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LEFTY2O00292 366 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TEX28O15482 410 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LCKP06239 509 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FPR1P21462 350 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AP1S2P56377 157 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OR2B6P58173 313 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ACSM2AQ08AH3 577 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ACSM2BQ68CK6 577 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZVU0 165 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VOPP1Q96AW1 172 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 APOL4Q9BPW4 351 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MMP27Q9H306 513 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KRT84Q9NSB2 600 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VPS4AQ9UN37 437 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.71□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 HAT1O14929 419 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 KPNA5O15131 536 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A5O15375 505 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 FAM20BO75063 409 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 LAMP1P11279 417 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 P2RX3P56373 397 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 WNT3P56703 355 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MTAPQ13126 283 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SP140Q13342 867 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GBX1Q14549 363 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 LYPD8Q6UX82 237 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TTYH2Q9BSA4 534 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 REEP1Q9H902 201 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RASSF1Q9NS23 344 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 E7EQ34 232 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GRM6O15303 877 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CXCL10P02778 98 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GPX2P18283 190 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CD22P20273 847 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 HTR3AP46098 478 aa12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NAE1Q13564 534 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms