RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL19P84098 196 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM168Q9H0V1 697 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DUXAA6NLW8 204 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GMFGO60234 142 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FCER2P06734 321 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MS4A2Q01362 244 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MEDAGQ5VYS4 303 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FOLH1BQ9HBA9 442 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EBLN1P0CF75 366 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IDSP22304 550 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4D2P58180 307 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GALNT2Q10471 571 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SEC23BQ15437 767 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 COQ8BQ96D53 544 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KCTD3Q9Y597 815 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP14O95059 124 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RCBTB2O95199 551 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IFNA21P01568 189 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKACAP17612 351 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 AKT2P31751 481 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LMO3Q8TAP4 145 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CNTN5O94779 1100 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RASGRP1O95267 797 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKCGP05129 697 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR1E2P47887 323 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 STC1P52823 247 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 E2F1Q01094 437 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LCN8Q6JVE9 175 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSWIM9Q86XI8 627 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 POGLUT1Q8NBL1 392 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MYRFLQ96LU7 910 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ARL6Q9H0F7 186 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.02■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MEN1O00255 615 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FLRT2O43155 660 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PROM1O43490 865 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 S100A12P80511 92 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NPRL3Q12980 569 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FAAH2Q6GMR7 532 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NATD1Q8N6N6 113 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GAB3Q8WWW8 586 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC29A1Q99808 456 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 C1QTNF8P60827 252 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 S100A10P60903 97 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RHEBQ15382 184 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SPHARQ15513 63 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR151Q8TDV0 419 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPA12BQ96MM6 686 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TM9SF2Q99805 663 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NLKQ9UBE8 527 aa18.02■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35G6P0C7Q6 338 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CMPK1P30085 196 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CREB5Q02930 508 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 C22orf42Q6IC83 251 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ADAP2Q9NPF8 381 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0G2JN53 185 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ST3GAL3Q11203 375 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HSDL2Q6YN16 418 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NUDT13Q86X67 352 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MT-ND5P03915 603 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KLK1P06870 262 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R43P59537 309 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GINS1Q14691 196 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TECRLQ5HYJ1 363 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms