RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ASPGQ86U10 573 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CEP97Q8IW35 865 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.26□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 FBF1Q8TES7 1133 aa7.26□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 H0YIG0 161 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 PCDH17O14917 1159 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 OR1F1O43749 312 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 Q0VFX4 171 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CSHL1Q14406 222 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 HERC3Q15034 1050 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 SARGQ9BW04 601 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 DERL2Q9GZP9 239 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PELI2Q9HAT8 420 aa7.25□□□□□ -1.25
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