RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358161.9

SPTAN1-201, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-201ENST00000358161 G6PC3Q9BUM1 346 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 REEP4Q9H6H4 257 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TAS2R7Q9NYW3 318 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TRBC2A0A5B9 178 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 H7BY64 318 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 FBLP22087 321 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 HSD11B1P28845 292 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 VIPR2P41587 438 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SMSP52788 366 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 MTTPP55157 894 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 VLDLRP98155 873 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PCLAFQ15004 111 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TMEM198Q66K66 360 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR2L5Q8NG80 312 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SCAMP4Q969E2 229 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PRAP1Q96NZ9 151 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 BTN3A3O00478 584 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SOX30O94993 753 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SEMA4FO95754 770 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 DHFRP00374 187 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ZNF20P17024 532 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 UQCRC2P22695 453 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PAMR1Q6UXH9 720 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 RABEPKQ7Z6M1 372 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TICAM1Q8IUC6 712 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 KLHL36Q8N4N3 616 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 C17orf62Q9BQA9 187 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TPK1Q9H3S4 243 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SAGE2PA6NJ88 616 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TP53I11O14683 189 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 G6PDP11413 515 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 UFM1P61960 85 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ABHD18Q0P651 414 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 GLIS1Q8NBF1 620 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR5T3Q8NGG3 340 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CD320Q9NPF0 282 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ARPC2O15144 300 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 NOBOXO60393 691 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 DMPKQ09013 629 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 HYAL2Q12891 473 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 APCDD1Q8J025 514 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 IFT46Q9NQC8 304 aa10□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 MID1O15344 667 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ASGR2P07307 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 DGKQP52824 942 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 LGI4Q8N135 537 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 MEIOBQ8N635 442 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR2T29Q8NH02 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 COPS4Q9BT78 406 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM25EA8MYX2 175 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR1I1O60431 355 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ADRB3P13945 408 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 GBX1Q14549 363 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 GPR153Q6NV75 609 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TP53INP1Q96A56 240 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CASD1Q96PB1 797 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 OR52B2Q96RD2 323 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TMEM233B4DJY2 109 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 RLN1P04808 185 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SPINT3P49223 89 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ZNF550Q7Z398 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ING3Q9NXR8 418 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 NRAPQ86VF7 1730 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 AIREO43918 545 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 C6orf47O95873 294 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 DSC3Q14574 896 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 COLEC12Q5KU26 742 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CCDC80Q76M96 950 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 PYURFQ96I23 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SPTAN1-201ENST00000358161 CD180Q99467 661 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms