RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PAGE2Q7Z2X7 111 aa9.7□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 NRROSQ86YC3 692 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB119Q8N690 84 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.7□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.7□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 GPR27Q9NS67 375 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 POT1Q9NUX5 634 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ICKQ9UPZ9 632 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 INVSQ9Y283 1065 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMG1O95456 288 aa9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 25.3
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RABGGTB-201ENST00000319942 KIR3DL1P43629 444 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A2P52569 658 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C21orf58P58505 322 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DS3Q14952 304 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCL1Q15111 1095 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR51B5Q9H339 312 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 STOML1Q9UBI4 398 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA3DO95025 777 aa9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 ETHE1O95571 254 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 EML2O95834 649 aa9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CPTPQ5TA50 214 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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