RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 EPN2O95208 641 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GBAP04062 536 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 DGKEP52429 567 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CSNK1G2P78368 415 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FOLH1Q04609 750 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC74AQ0VAA2 488 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MED21Q13503 144 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf111Q8N326 155 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT4Q8N4A0 578 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CXCR6O00574 342 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 KLK1P06870 262 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PDE7AQ13946 482 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 DEPDC1Q5TB30 811 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM145Q8NBT3 493 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PHF12Q96QT6 1004 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FEZF1A0PJY2 475 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CYP4F2P78329 520 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF621Q6ZSS3 439 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 IKBIPQ70UQ0 350 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RD3Q7Z3Z2 195 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GATA6Q92908 595 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CIB1Q99828 191 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 Q9H521 79 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SH3BP4Q9P0V3 963 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CLIC1O00299 241 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FURINP09958 794 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SLC14A1Q13336 389 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA11Q86U17 422 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SEPHS2Q99611 448 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CENPKQ9BS16 269 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ATAD3AQ9NVI7 634 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 V9GYQ6 96 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TXNDC9O14530 226 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TOR1BO14657 336 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 DENRO43583 198 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC18P0CG32 403 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CHRNB1P11230 501 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ENGP17813 658 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFS1P28331 727 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CCR5P51681 352 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R50P59544 299 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PRKCQQ04759 706 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf80Q0P641 193 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF385BQ569K4 471 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FAM162AQ96A26 154 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MTERF3Q96E29 417 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FAM149AA5PLN7 773 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PLPP1O14494 284 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 EML2O95834 649 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4-34P06331 123 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CCT8P50990 548 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ABATP80404 500 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6AP1Q15904 470 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PPCDCQ96CD2 204 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RNF145Q96MT1 663 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CHID1Q9BWS9 393 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 OR1F1O43749 312 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RETP07949 1114 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GPX2P18283 190 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ACTR1BP42025 376 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ACTR1AP61163 376 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ALG11Q2TAA5 492 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0895LQ68EN5 471 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SYT13Q7L8C5 426 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ADCK2Q7Z695 626 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 NCLNQ969V3 563 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF597Q96LX8 424 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms