RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SCAIQ8N9R8 606 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR52J3Q8NH60 311 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SCLYQ96I15 445 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MBOAT4Q96T53 435 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MND1Q9BWT6 205 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM17Q9Y577 477 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SERTM1A2A2V5 107 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PSMD11O00231 422 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AOC2O75106 756 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RHCEP18577 417 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GSTM3P21266 225 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 S100A1P23297 94 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ALDH4A1P30038 563 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 WEE1P30291 646 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CCR7P32248 378 aa8.53□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 RORCP51449 518 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SGSHP51688 502 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IST1P53990 364 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PIGFQ07326 219 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TAB1Q15750 504 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 REEP3Q6NUK4 255 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF675Q8TD23 568 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GLYATL1Q969I3 302 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SP140LQ9H930 580 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRU2 124 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 M0QX08 132 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1G1O75348 118 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C6orf47O95873 294 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 JUNDP17535 347 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AGXTP21549 392 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD70P32970 193 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SELENOWP63302 87 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CYP4F2P78329 520 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC34A3Q8N130 599 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 VMP1Q96GC9 406 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CLCA1A8K7I4 914 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CHST10O43529 356 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRSS23O95084 383 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GGT2P36268 569 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OPRL1P41146 370 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DCDC1P59894 354 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CDC73Q6P1J9 531 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NUDT13Q86X67 352 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ENKURQ8TC29 256 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OTULINQ96BN8 352 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SMIM14Q96QK8 99 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NUP205Q92621 2012 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CCDC182A6NF36 153 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 H0YIV9 168 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GABARAPO95166 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NFATC1O95644 943 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 F11P03951 625 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UGT2B10P36537 528 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCR8P51685 355 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TEKQ02763 1124 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RELAQ04206 551 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MICAQ29983 383 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PNCKQ6P2M8 343 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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