RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 SERPINB11Q96P15 392 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 RAB23Q9ULC3 237 aa6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 ARID2Q68CP9 1835 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 A0A1B0GVC2 190 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 PIPSLA2A3N6 862 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 A6NIN4 97 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 B4DXG7 233 aa6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 GON7Q9BXV9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 KIR2DL3P43628 341 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 RGRP47804 291 aa6.44□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.44□□□□□ -1.38
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LMO3-235ENST00000616247 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 BOCQ9BWV1 1114 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 ASB8Q9H765 288 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-235ENST00000616247 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.44□□□□□ -1.38
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