RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	AGA	P20933	346 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP6	P55212	293 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RHAG	Q02094	409 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CTBP1	Q13363	440 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PTK6	Q13882	451 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR21	Q99679	349 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AP3B1	O00203	1094 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM10	O14672	748 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PFDN6	O15212	129 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF5C	O60282	957 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT38	O76015	456 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN14	O95500	239 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC1A2	P43004	574 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS41	P49754	854 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AGTR2	P50052	363 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SMS	P52788	366 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK16	Q00536	496 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TESK1	Q15569	626 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	EXT1	Q16394	746 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MEP1A	Q16819	746 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP11	Q8TF27	550 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	HCFC1	P51610	2035 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB6	O75190	326 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GALT4	O96024	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FGG	P02679	453 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MYBL2	P10244	700 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CD46	P15529	392 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SSTR2	P30874	369 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA6	P43360	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A5	P58743	744 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MPP1	Q00013	466 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NSDHL	Q15738	373 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPG	Q86U10	573 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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